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Tabelle D2 zeigt eine Übersicht der Ergebnisse der Bestimmung der Ammoniakfreisetzung.

GTPase

RhoA

Cdc42

Rac1

TC10

RhoC

RhoB

RhoG

RhoD

Deami-

dierung

Tab. D2: Deamidierung durch CNF1 – Übersicht

Cdc42, Rac1, TC10, RhoC, RhoB und RhoG werden von CNF1 deamidiert. RhoD wird nicht deamidiert.

II.3 Aminosäuresequenzvergleich der Switch-II-Regionen der getesteten Rho-GTPasen

Zur Untersuchung der Substratspezifität von DNT und CNF1 wurden die Switch-II-Regionen

der getesteten Rho-GTPasen verglichen, da diese Region besonders wichtig für das Angreifen

der beiden Toxine ist. Es wurde nach Abweichungen der Aminosäuresequenzen von RhoD

und RhoG gegenüber den modifizierbaren Rho-GTPasen gesucht, die die Ursache dafür sein

könnten, dass RhoG und RhoD nicht transglutaminiert und RhoD nicht deamidiert wird.

Rho-GTPase

Switch-II-Region (As 62-78)

62 63 68 72 78

RhoA

G Q E D Y D R L R P L S Y P D T D

Rac1

G Q E D Y D R L R P L S Y P Q T D

Cdc42

G Q E D Y D R L R P L S Y P Q T D

RhoB

G Q E D Y D R L R P L S Y P D T D

RhoC

G Q E D Y D R L R P L S Y P D T D

TC10

G Q E D Y D R L R P L S Y P M T D

RhoG

G Q E E Y D R L R T L S Y P Q T N

RhoD

G Q D D Y D R L R P L F Y P D A N

Abb. D6: Switch-II-Regionen aller getesteten Rho-GTPasen

fett gedruckt: abweichende Aminosäuren; kursiv gedruckt: von Lerm et al untersuchte Aminosäuren R 68 und L

72 (Lerm, 1999a);

RhoG unterscheidet sich in der Switch-II-Region von den anderen GTPasen durch drei, RhoD

durch vier Aminosäuren (Abb. D6).

RhoG weist an Position 65 ein Glutamat statt wie die anderen GTPasen ein Aspartat auf. Die

Seitenkette von Glutamat ist um ein Kohlenstoffatom länger als die von Aspartat, aber in

Ladung und Polarität gleich. Weiterhin befindet sich an Position 71 ein Threonin statt einem

1 2 ... 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 ... 93 94

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